Metodický seminář „Jak na mikrobiom“
Dobrý den,
v České mikrobiomové společnosti si uvědomujeme, jak nesmírně dynamický je vývoj ve všech oblastech výzkumu mikrobiomu. Pro osamoceného výzkumníka či výzkumnici je docela obtížné udržet krok s dobou ve všem, ale my jsme, stejně jako bakterie v biofilmu (Buď jako bakterie, spolupracuj!) vsadili na spolupráci a nabízíme metodický seminář. Půjde především o přátelskou výměnu zkušeností – v každém bloku přednášek bude vyhrazena delší doba pro diskuzi, sdílení vašich zkušeností a řešení problémů.
Kdy:
3.–4. února 2026
Kde:
Zámek Třešť
Aktivní účast:
možnost posterové prezentace
Program:
Sekvenační technologie a novinky
Představení sekvenačních služeb
Sekvenace genu pro 16S rRNA
- příprava knihoven pro sekvenování krátkých amplikonů
- příprava knihoven pro sekvenování celého genu 16S RNA
- bioinformatická analýza dat
Celometagenomové sekvenování
- příprava knihoven
- zkušenosti se sekvenacemi z přístrojů využívajících technologii dlouhého čtení
- bioinformatické zpracování dat
Biostatistika v analýze mikrobiomu
- nahrazování chybějících hodnot, filtrace dat, alfa a beta diverzita, diferenční abundanční analýza, prediktivní modely
Tento seminář je pořádán s podporou projektu OP JAK Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy České republiky č. CZ.02.01.01./00/22_008/0004597
Těšíme se na setkání
Petra Vídeňská
Monika Cahová
